中科脂典近期客户代表性文章选集
01摘要：
人类肠道微生物组主要通过粪便样本进行研究，这一实践产生了有关胃肠道微生物群落组成和功能能力的重要知识。然而，这种对粪便材料的依赖限制了胃肠道其他部位微生物动态的研究，粪便样品的不经常可用性妨碍了更精细时间尺度的分析。在我们的研究中，我们利用结肠经内镜肠内插管，一种最初用于粪便微生物群移植的技术，每天两次采样回盲部微生物群，然后对这些样本进行宏基因组和宏转录组分析。共收集了5名健康志愿者的43份回盲部和28份尿液和粪便样本。五名志愿者的回盲部和粪便微生物群在宏基因组图谱上相似，但它们的活性基因（转录组）却非常不同。两种微生物群在泻药暴露后都受到干扰，随着时间的推移，它们表现出与预处理状态的差异性降低，从而显示出肠道微生物组固有的弹性，尽管它们在我们的观察时间窗口内没有完全恢复。在白天和晚上对回盲部微生物组进行取样，发现一系列细菌种类和功能途径存在昼夜节律，特别是与短链脂肪酸产生有关的细菌，如痤疮丙酸杆菌和辅酶A生物合成II。自相关分析和波动分解进一步表明了日振荡的显著周期性。粪便和尿液样本中的代谢组学分析反映了肠道微生物组的扰动和恢复，表明肠道微生物组对许多与宿主健康有关的关键代谢物的重要贡献。这项研究提供了对人类肠道微生物组及其内在弹性和昼夜节律的新见解，以及这些对宿主的潜在后果。
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